Организационная структура МИЭТ — линейно-функциональная с применением элементов матрично-сетевой модели управления.

Основными звеньями системы управления университета являются: ректор, Ученый и Наблюдательный советы, институты и кафедры. Проректоры осуществляют административно-управленческие функции по основным направлениям деятельности, что обеспечивает относительную децентрализацию и позволяет своевременно решать стратегические и оперативные задачи структурных подразделений.

Общее руководство Программой осуществляет ректор Университета, Наблюдательный совет участвует в рассмотрении и согласовании программы развития, Ученый совет и Конференция работников и обучающихся осуществляют широкое обсуждение хода реализации Программы.

Модернизация системы управления подразумевает:

- создание Офиса технологического лидерства университета, который станет основным органом, отвечающим за разработку и сопровождение хода реализации стратегии достижения технологического лидерства университета, а также выполнение стратегических технологических проектов, коммерциализацию результатов, работу и привлечение к участию представителей квалифицированного заказчика, экспертов из реального сектора экономики, инженеров и исследователей в качестве партнеров и заказчиков для осуществления научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ на базе университета;

- актуализацию деятельности Стратегического совета Программы развития с включением в его состав представителей высокотехнологичных компаний- партнеров.

Стратегический совет - коллегиальный орган, осуществляющий долгосрочное перспективное планирование реализации Программы, корректирует стратегические технологические проекты на предстоящий период, управляет бюджетом Программы, включая организацию привлечения дополнительных финансовых средств, принимает решения по предложениям Дирекции Программы развития. Стратегический совет для осуществления контроля экономической эффективности деятельности в рамках реализации Программы создает бюджетную комиссию.

Офис технологического лидерства решает стоящие перед ним задачи в команде с Дирекцией Программы развития, Управлением инновациями и Департаментом науки и технологий.

Оперативное управление, мониторинг и контроль хода реализации Программы осуществляет Дирекция Программы развития. Дирекция отвечает за актуализацию и корректировку «дорожной карты» (плана) реализации Программы, анализ и оценку показателей комплексного развития университета, организацию нормативного и документационного обеспечения процессов реализации Программы, развитие системы внутреннего и внешнего мониторинга, контроля бизнес-процессов и оценки качества результатов процессов университета.

Управление инновациями реализует задачи, направленные на повышение эффективности инновационной и технико-внедренческой деятельности обучающихся и сотрудников, выполняет работы по инициации научно-технических проектов совместно с индустриальными партнерами в рамках программы развития университета.

Департамент науки и технологий осуществляет управление и координацию научных исследований университета, оценку эффективности научной деятельности, анализ результатов исследований и их влияния на развитие науки и техники. Устанавливает и поддерживает связи с научно-исследовательскими центрами, организует участие в научно-исследовательских проектах, в том числе с международным участием.

Система управления реализацией Программы - проектно- ориентированная и предполагает в рамках каждого Стратегического проекта формирование команды реализации проекта с широким привлечением молодых ученых и талантливых студентов, которая: планирует, организует, координирует и контролирует все процессы в рамках проекта; использует цифровые сервисы управления проектами Программы; разрабатывает и координирует выполнение «дорожной карты» (плана) реализации проекта, включающей мероприятия, подпроекты, сроки их реализации, объем финансирования, привлекаемых партнеров (участников Консорциума) и ожидаемые результаты; осуществляет мониторинг результатов реализации проектов.

Для повышения эффективности реализации приоритетных комплексных проектов в рамках проектов технологического лидерства будет сформирован институт «главных конструкторов» - ответственных за реализацию ключевых научнотехнологических направлений.

Взаимодействие команд/подразделений будет осуществляться через цифровые сервисы планирования и управления совместной работой. Для этого будут использоваться современные инструменты, которые помогут эффективно распределять задачи, контролировать сроки и обмениваться информацией между всеми участниками рабочих процессов.